Michigan hatte vor dem Spiel gegen Indiana einen klaren Plan für die Quarterback-Position, doch Coach Kyle Whittingham wollte nicht verraten, wer spielen würde. Tommy Carr startete am 24. Oktober gegen Indiana. Michigan verlor das Heimspiel mit 6:13 nach Verlängerung.

Carr hatte Underwood bereits am 17. Oktober im Spiel gegen Penn State zur Halbzeit abgelöst. Underwood kam auf fünf vollständige Pässe bei elf Versuchen für 43 Yards und zwei Interceptions. Carr brachte fünf von sieben Pässen für 47 Yards an, erlief 36 Yards und erzielte einen Touchdown. Michigan gewann die Partie mit 21:18.

Nach der Niederlage gegen Indiana kritisierte Whittingham die Offensive. Als zentrale Probleme nannte er das Laufspiel, fehlende Touchdowns in der Red Zone und den Verlust des Ballbesitzes.